Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sh3bp2Q06649 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp2Q06649 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sh3bp2Q06649 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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