Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms