Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sox9Q04887 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms