Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnb1Q03717 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms