Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg2Q03517 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms