Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tff2Q03404 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms