Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms