Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NfiaQ02780 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms