Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cacna1cQ01815 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms