Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col1a2Q01149 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col1a2Q01149 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms