Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms