Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms