Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Casp7P97864 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casp7P97864 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casp7P97864 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casp7P97864 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms