Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gfra1P97785 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms