Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SmsP97355 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SmsP97355 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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SmsP97355 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SmsP97355 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmsP97355 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SmsP97355 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SmsP97355 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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