Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gbx1P82976 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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