Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgcgP82348 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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