Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiitaP79621 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiitaP79621 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiitaP79621 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms