Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rad54lP70270 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54lP70270 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms