Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SbdsP70122 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SbdsP70122 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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