Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Lmo4P61969 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms