Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sem1P60897 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sem1P60897 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms