Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms