Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcbp1P60335 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms