Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab4aP56371 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rab4aP56371 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rab4aP56371 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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