Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms