Protein–RNA interactions for Protein: P51827

Aff3, AF4/FMR2 family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff3P51827 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aff3P51827 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aff3P51827 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Aff3P51827 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Aff3P51827 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff3P51827 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff3P51827 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff3P51827 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff3P51827 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff3P51827 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Aff3P51827 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aff3P51827 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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