Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
FmodP50608 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FmodP50608 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms