Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms