Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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