Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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