Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms