Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtgfrP43117 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms