Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gdf6P43028 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdf6P43028 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms