Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms