Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lig1P37913 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms