Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Saa4P31532 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Saa4P31532 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms