Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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