Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccnd3P30282 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccnd3P30282 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms