Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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