Protein–RNA interactions for Protein: P28662

Bri3, Brain protein I3, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bri3P28662 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Bri3P28662 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms