Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa2P28309 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms