Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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