Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2afxP27661 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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