Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
U2af2P26369 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms