Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CftrP26361 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CftrP26361 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CftrP26361 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CftrP26361 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CftrP26361 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CftrP26361 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CftrP26361 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CftrP26361 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CftrP26361 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CftrP26361 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CftrP26361 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms