Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NdnP25233 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NdnP25233 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NdnP25233 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NdnP25233 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NdnP25233 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NdnP25233 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NdnP25233 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NdnP25233 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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