Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkchP23298 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PrkchP23298 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkchP23298 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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