Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms