Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ms4a2P20490 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms